محمدتقی فاضل‌میبدی، عضو مجمع محققین و مدرسین حوزه علمیه قم نوشت: گاهی گفته‌هایی ازبرخی منتشر می‌شود که نمی‌توان از کنار آن به سادگی گذشت. آقایی در مجلس از قول مصباح‌یزدی می‌گوید که ایشان ولایت مطلقه فقیه را کافی نمی‌دانست، بلکه قایل بود که اطاعت مطلقه فقیه باید در کنارش باشد. یعنی فاتحه مجلس را باید خواند و قانون اساسی را به کتابخانه‌ها سپرد.
فاضل میبدی : امروز به نظر من اگر روحانیت ما تا آنجایی که می‌تواند مناصب کشور را به دست انسان‌های کاربلد بسپارد ولو اینکه کار را درست انجام می‌دهند یا نمی‌دهند، موثر خواهد بود.
عضو مجمع محققین و مدرسین حوزه علمیه قم گفت: چهارشنبه‌سوری نه نماد شرک و کفر است، و نه نماد چیزی‌که با دین در تضاد باشد، جزو فرهنگ مردم و فرهنگ باستانی ایرانی است، بالاخره ایرانی‌ها برای چهارشنبه آخر سال احترام قائل بودند، لذا اگرچه خیلی از موارد دینی نیستند، اما در تضاد با دین هم نیستند.
محمدتقی فاضل میبدی عضو مجمع محققین و مدرسین حوزه علمیه قم به هشدار امام جمعه اصفهان واکنش تندی نشان داد و نوشت: جناب امام جمعه! کدام فقیهی برای نهی از منکر چنین روشی را مجاز دانسته